我校创建于1988年9月，原名为福州市经济技术开发区培英中学，1993年4月更名为福州市经济技术开发区培英学校。1996年9月，马尾区人民政府与福建师大开展联合办学，将原培英学校和福建省海洋渔业总公司职工子弟中学合并，组建成福建师范大学第二附属中学。学校于2000年1月我校实现三级达标；2004年12月实现二级达标；2013年3月省教育厅发文，确认我校晋升省一级达标高中。

现有校园面积64295.3㎡,学校建筑总面积33457.4㎡。拥有国家田联验收的标准田径场、省级中学示范图书馆、能容纳600多人的学生公寓楼，信息技术设施完备，拥有校园局域网，所有教室配有多媒体教学设备。各类专用教室、探究室配备齐全。学校校园面积、校舍建筑面积、绿地面积等指标均达到省一级达标高中评估标准。